НГУЕН ТХИ ЧАНГ¹, КОВАЛЕВА Н.С.²

1- Южный федеральный университет, Ростов-на-Дону, Россия

2- Ростовский государственный медицинский университет, Ростов-на-Дону, Россия

РАЗРАБОТКА ТЕСТ-СИСТЕМЫ ДЛЯ ОЦЕНКИ РИСКА РАЗВИТИЯ ИНСУЛЬТА НА ОСНОВЕ ГЕНОМНЫХ МАРКЕРОВ

В последние десятилетия достигнуты впечатляющие успехи в области молекулярной генетики человека, позволившие от формального описания законов наследования перейти к полной расшифровке человеческого генома. Одной из актуальных проблем современного здравоохранения является выяснение молекулярно-генетических основ развития сосудистых заболеваний. В связи с этим нами предприняты попытка создания нового способа определения индивидуального генетического риска развития инсульта на основании анализа полиморфных ДНК маркеров жителей Ростовской области.

Целью нашего исследовании является создание нового способа определения индивидуального генетического риска развития инсульта на основании анализа полиморфных ДНК маркеров жителей Ростовской области.

За время исследования была сформирована выборка больных острым ишемическим инсультом, в которую включены 300 человек. А также создана контрольная популяционная выборка из 280 здоровых доноров. Материалом исследования являлись пробы из периферической крови обследуемых. Высокая производительность молекулярно-генетического метода выявления полиморфных аллелей исследуемых генов у больных инсультом позволяет оценить большое количество полиморфизмов одновременно.

В результате исследования было установлена ассоциация полиморфных маркеров следующих генов-кандидатов с развитием острого нарушения мозгового кровообращения: Гены системы свертывающей крови (L33P гена ITGB3, C807T гена ITGA2, A20210G гена F2, A1691G гена F5); Гены, участвующие в метаболизме липидов (C3238G гена APOC3, L28P гена APOE, Q192R гена PON1, I495V гена CETP, V771M гена ABCA1); Гены, регулирующие артериальное давление и состояние сосудов (М235Т гена AGT, С1166А гена AGTRI, C786T гена eNOS). Частоты генотипов, полученные в результате исследования, демонстрируют наличие ассоциации с инсультом исследованных генов. Проведен сравнительный анализ распределения ДНК маркеров разных типов у больных инсультом и в контрольной выборке с использованием различных методов математической статистики, в результате чего были выявлены наиболее информативные маркеры острого инсульта для ростовской популяции. Нами предложен алгоритм создания биочипов для анализа генетического полиморфизма на примере детекции мутаций в генах REN (I9-83G>A), AGT (М235Т), AGTRI (1166А>С), AGTR2 (31230А), eNOS (C786T), ITGB3 (L33P), ITGA2 (C807T), c.20210G>A гена F2, c.1691G>A гена F5, (-5)T>C Kozak гена GP1BA, c.675_676delinsG гена PAI-1, APOC3 (C3238G), APOE (L28P), PON1 (Q192R), CETP (I495V), LDLR (С16730Т), LPL (S447X), ABCA1 (V771M).

Наряду с новыми методиками и технологиями, не менее важным для медицинской генетики является разработка методологических основ анализа генетического полиморфизма, которая заключается, прежде всего, в адекватном выборе генов-кандидатов, групп обследуемых пациентов и методов анализа данных. Для выяснения роли генетических факторов в развитии артериальной гипертензии были выбраны полиморфные варианты генов, продукты которых участвуют в регуляции метаболизма липидов, свертывающей системы крови и состояния сосудов.

И хотя изучение генетической предрасположенности к различным мультфакториальным заболеваниям как область медицинской генетики быстро и активно развивается, становиться, очевидно, что ее совершенствование в будущем не возможно без развития методической базы, прежде всего, технологии биологических микрочипов, и выработки определенных методологических подходов, позволяющих анализировать полиморфизм по многим генам одновременно.

В рамках нашего исследования была создана панель маркеров больных острым инсультом и здоровых лиц из ростовской популяции с использованием технологии, позволяющей одновременно анализировать несколько сотен однонуклеотидных сайтов и участков генома с варьирующим числом копий. Разработанная тест-система и проводимая на ее основе генодиагностики будет способствовать снижению заболеваемости острым инсультом в Российской популяции за счет осуществления комплексной направленной профилактики у лиц с генетически обусловленным повышенным риском развития инсульта.

NGUYEN THI TRANG¹, KOVALEVA N.S.²

1 - Southern Federal University, Rostov-on-Don, Russia

2 - Rostov State Medical University, Rostov-on-Don, Russia

DEVELOPMENT TEST-SYSTEM FOR EVALUATION OF THE RISK OF STROKE-BASED GENOMIC MARKERS

Abstract: The paper presents the results of their research association of polymorphic markers of candidate genes with the development of stroke in persons, who live in the Rostov region Russia Federation. As part of our study was set up the panel of markers in patients with acute stroke and healthy individuals from the population of the Rostov using technology that allows to simultaneously analyze several hundred single nucleotide sites and regions of the genome with varying numbers of copies. The developed test system and carried out based on it genodiagnostic will reduce the incidence of acute stroke in the Russian population by implementing a comprehensive prevention aimed at persons with genetically determined increased risk of stroke.